分类一、荷花栽培品种很多，依用途不同可分为藕莲、子莲和花莲三大系统。根据《中国荷花品种图志》的分类标准共分为3系、5群、23类及28组。
　　中国莲系
　　一、大中花群：
　　a.单瓣类：1.单瓣红莲组2.单瓣粉莲组3.单瓣白莲组
　　b.复瓣类：4.复瓣粉莲组
　　c.重瓣类：5.重瓣红莲组6.重瓣粉莲组7.重瓣白莲组8.重瓣洒锦组
　　d.重台类：9.红台莲组
　　e.千瓣类：10.千瓣莲组
　　二、小花群：
　　f.单瓣类：11.单瓣红碗莲组12.单瓣粉碗莲组13.单瓣白碗莲组
　　g.复瓣类：14.复瓣红碗莲组15.复瓣粉碗莲组16.复瓣白碗莲组
　　h.重瓣类：17.重瓣红碗莲组18.重瓣粉碗莲组19.重瓣白碗莲组
　　美国莲系
　　三、大中花群：
　　i.单瓣类：20.单瓣黄莲组
　　中美杂种莲系
　　四、大中花群：
　　j.单瓣类：21.杂种单瓣红莲组22.杂种单瓣粉莲组23.杂种单瓣黄莲组24.杂种单瓣复色莲组
　　k.复瓣类：25.杂种复瓣白莲组26.杂种复瓣黄莲组
　　五、小花群：
　　l.单瓣类：27.杂种单瓣黄碗莲组
　　m.复瓣类：28.杂种复瓣白碗莲组
　　分类二
　　中国荷花品种资源丰富，约达200个以上。荷花品种分类是以荷花人工栽培的历史演进为依据，并适当结合栽培应用的实际。种和种型是品种分类的前提，其下以株型大小为一级分类标准，花的重瓣性为二级分类标准，花色为三级分类标准。凡核于口径26厘米以内盆（缸）中能开花，平均花径不超过12厘米，立叶平均直径不超过24厘米、平均高不超过33厘米者为小型品种（碗莲）；凡其中某一项超过指标，即列入大、中株型品种。按此分类方法，包括3系5群12类28组。
　　中国莲系
　　一、大中花群：
　　a.单瓣类：瓣数2～20。
　　1.红莲组如"古代莲"等。2.粉莲组如"东湖红莲"等。3.白莲组如"东湖白莲等。
　　b复瓣类：瓣数21～590
　　4.粉莲组如"唐婉"等。
　　c.重瓣类：瓣数60～190。
　　5.红莲组如"红千叶"等。6.粉莲组如"落霞映雪"等。7.白莲组如"碧莲"等。8.洒金莲组仅见1种，即"大洒锦"。
　　d.重台类
　　9.红台莲组仅见Ⅰ组1种，即"红台莲"（"重台莲"）。
　　e.千瓣类
　　10.千瓣莲组仅见Ⅰ组1种即"千瓣莲"。
　　"千瓣莲"为荷中珍品，自古有之。其变态的花托可分成两个或两个以上的轴心，花开放时外瓣层层谢薄，内层碎瓣（即小花瓣）不断增生，并旋转成两个或多个花心。外观成双花心考称"并蒂莲"，三个花心者称"品字莲"，四个花心者称"四面莲"，多个花心者称"五子莲"、"绣球莲"等，均不结莲蓬。其实，这些都是一种"千瓣莲"的花态变异现象，不能各自成为品种。
　　另有种并蒂现象，即荷花的花芽在分化过程中，受到某种外界环境条件的影响，而分成两个分生中心，进而发育成两个象是双脑胎的花蕾，于是在一支花柄上并开两朵花，结一对莲蓬。此系偶然现象，亦非品种特征，不能遗传。
　　二、小花群（碗莲群）：
　　f.单瓣类：瓣数2～200
　　11.红碗莲组如"火花"等。12.粉碗莲组如"童羞面"等。13.白碗莲组如"娃娃莲"等。
　　g.复瓣类瓣数21～590
　　14.红碗莲组如"案头春"等。15.粉碗莲组如"粉碗莲"等。16.白碗莲组如"星光"等。
　　h.重瓣类瓣数600~1300
　　17.红碗莲组如"羊城碗莲"等。18.粉碗莲组如"小醉仙"等。19.白碗莲组如"白雪公主"等。
　　美国莲系
　　三、大中花群：
　　i.单瓣类
　　20.黄莲组如"黄莲花"